Généalogie génétique - Anciens génomes de chasseurs-cueilleurs du Cameroun - Commentaires2024-03-29T12:35:24+01:00Bernardurn:md5:27a7020e33c8b33757a3207ee2825750DotclearAnciens génomes de chasseurs-cueilleurs du Cameroun - FWAurn:md5:308a08cc8a6bd7664ed5b310d837ad282020-02-13T04:25:20+01:002020-02-13T04:25:20+01:00FWA<p>Bonjour,</p>
<p>Le graphe de mélange génétique corrobore les résultats de papiers précédants sur l’ADN autosomique (Patin et al, 2017) et du chromosome Y (D’Atanasio et al, 2018) des populations Bantoues.</p>
<p>E-M2 avait été initialement associé à l’expansion Bantoue. Seulement le papier de D’Atanasio révèle d’autres lignages paternels, appartenant à E-M2 et datant de la période humide du Sahara (~10,000-5,000 ans). E-CTS9883 (equiv. E-Z15939) et ses sous-clades sont restreints dans les parties les plus à l’ouest de l’Afrique de l’ouest (Sénégambie) et à une faible fréquence en Afrique du Nord. En revanche, les clades E-U290 et E-U174, sont largement représentées chez les populations Bantoues.</p>
<p>Autre élément : il n’y a pas d’ADN, extrait des fossiles provenant de Jebel Irhoud. En effet, on peut se demander si la présence de Jebel aurait pu contenir des infos supplémentaires, notamment concernant cette population fantôme. Dans la section dédiée aux modèles alternatifs, un des modèles (Extended Data Fig. 5: Schematic of first alternative admixture graph.) intègre les anciens individus de Taforalt du Maroc, associés à la culture ibéromaurusienne. Leur positionnement indique une divergence à un point rapproché de celle d’une population fantôme (Ghost North African) qui aurait contribuée à l’ascendance des populations des individus de Shum Laka. Il s’agit probablement du début d’une longue série de modèles de ce genre.</p>
<p>On peut aussi s’interroger sur l’origine exact de l’haplogroupe E et sa diffusion au sein de l’Afrique qui restent encore des questions ouvertes. Parmi les généticiens, il n’y pas de consensus. <a href="https://en.wikipedia.org/wiki/Haplogroup_E-M96#Origins" title="https://en.wikipedia.org/wiki/Haplogroup_E-M96#Origins" rel="ugc nofollow">https://en.wikipedia.org/wiki/Haplo...</a></p>
<p>Tout récemment, un nouveau papier vient d’être publié par Akey et ses collègues :<br />
“Identifying and Interpreting Apparent Neanderthal Ancestry in African Individuals” <a href="https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20" title="https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20" rel="ugc nofollow">https://www.cell.com/cell/fulltext/...</a>)30059-3#secsectitle0080</p>
<p>Les auteurs suggèrent une contribution ancienne d’ADN néandertal (à l’aide d’IBD mix) chez les populations africaines actuelles, suite à une migration d’anciens Européens vers l’Afrique.</p>Anciens génomes de chasseurs-cueilleurs du Cameroun - Bernardurn:md5:fdb03950d03b37d790c8cc70c8a76c822020-02-08T13:35:15+01:002020-02-08T13:35:15+01:00Bernard<p>Bonjour Rivi,<br />
Oui c'est bien possible car la date de divergence de la population fantôme avec le reste de la population est équivalente à la date de divergence de l'haplogroupe A00 avec les autres branches. Quant au crâne d'Iwo Eleru, il nous faudrait des tests ADN pour en savoir plus.</p>Anciens génomes de chasseurs-cueilleurs du Cameroun - Riviurn:md5:101d09d25677e368a6e3cbee280ca1dc2020-02-07T18:47:48+01:002020-02-07T18:47:48+01:00Rivi<p>Merci Bernard et encore bravo pour cet excellent résumé<br />
Une question : pourrait on rapprocher l'haplogroupe A00 de la population "ghost archaic" et éventuellement des restes retrouvés sur le site voisin d'Iwo Eleru ?<br />
Bien à vous</p>Anciens génomes de chasseurs-cueilleurs du Cameroun - liganolurn:md5:fd2f67dbdd7f21a9d06f878447efb4d52020-01-26T23:13:32+01:002020-01-26T23:13:32+01:00liganol<p>Formidable ! J'espérais depuis longtemps un article de ce genre sur des tests génétiques faites sur des restes préhistoriques provenant de l'Afrique de l'Ouest ou Central et précédant l'expansion bantou, et l'article n'a pas déçu mes attentes.</p>
<p>Pour commencer je constate que l'haplogroupe-Y de tous ces enfants morts il y a 3000 et 8000 ans sont A et B, ce qui confirme la théorie dominante chez certains spécialistes qui prétendent que alors qu'aujourd'hui l'haplogroupe E est largement dominant en Afrique subsaharienne, auparavant, il y a des millénaires de cela, l'Afrique de l'Ouest, l'Afrique Central et l'Afrique du Sud etaient habités que par des porteurs des haplogroupes A et B et que l'haplogroupe E était surtout confiné à l'Est de l'Afrique. Selon eux il y a 8000 ans il y a eu une migration de l'Est vers l'Ouest de l'Afrique par des porteurs de l'haplogroupe E qui parlaient la langue nigéro-congolaise unifié, qui est de loin la famille de langue la plus parlée aujourd'hui en Afrique subsaharienne et qui sont aussi les ancêtres des Bantous. Selon cette théorie au fil des millénaires les porteurs des langues nigero-congolaise qui étaient aussi porteurs de l'haplogroupe E finiront par complètement absorber les porteurs des haplogroupes autochtones A et B jusqu'à complètement dominer l'Afrique sub-saharienne, ce qu'ils devront surtout à leurs descendants bantous dont l'expansion des millénaires plus-tard dans l'Ouest, le centre et le sud de l'Afrique allait amené les langues bantous, qui descendent eux-même d'une langue nigéro-congolaise, dans tous ces régions ainsi que l'haplogroupe E qui finirait par recouvrir tous les haplogroupes autochtones de ces régions , qui sont devenus aujourd'hui mineurs. Il est ainsi curieux de constater que les enfants morts il y a 3000 ans ne portent pas l'haplogroupe E, ce qui laisse penser que bien que, si on en croit les théories dominantes à ce sujet, des porteurs de l'haplogroupe E habitaient déjà la région il y a des millénaires et que même probablement le peuple bantou originel se trouvait dans cette région ou pas trop loin comme le dit l'article, les autochtones étaient encore très présents dans la région et n'avaient pas encore été autant absorbés qu'ils le seront plus-tard ; enfin c'est une hypothèse que je fais, j'en ai conscience , à partir de peu d'échantillons.</p>
<p>Ensuite je note aussi l'haplogroupe-Y A00 parmi l'un de ces enfants morts il y a 8000 ans, ce qui est curieux quand on pense qu'aujourd'hui cet haplogroupe est quasiment inexistant comme le dit l'article et ne se retrouve presqu'au Cameroun, où se trouve justement le site archéologique en question. C'est fou de penser qu'il y a une certaine continuité génétique dans la région depuis au moins 8000 ans. Il est probable que contrairement à aujourd'hui, à l'époque cet haplogroupe était beaucoup plus commun dans cette région.</p>
<p>Et pour finir, la partie la plus fascinante de cet article est la découverte de cette population fantôme qui avait aussi été prédite par certains spécialistes qui prétendaient que l'expansion bantou avaient à ce point chamboulé le paysage génétique de l'Afrique sub-saharienne qu'il avait masqué les anciennes interactions entre les différents peuples d'Afrique d'antan ainsi que les anciens mouvements de populations et le profil génétique d'anciens peuples de la région, et selon eux l'étude de plus d'ADN d'Africains sub-sahariens préhistoriques nous en apprendrait beaucoup sur l'ancienne histoire de l'Afrique mais aussi de l'humanité et justement la découverte de cette population fantôme les donnent en quelque sorte raison. Je pense qu'on ne peut pas imaginer tous les découvertes qu'on ferait si on pouvait trouver plus de restes préhistoriques d'Afrique sub-saharienne sur lesquels on pourrait faire des analyses génétiques, surtout l'un âgé de plus de 30 000 ans, mais étant donné que le sol de ces régions est très acide ce genre de découvertes est peu probable, mais on ne sait jamais et on a le droit de rêver.</p>