La forte corrélation entre la distribution géographique de quelques sous-clades majeures de l'haplogroupe E du chromosome Y et la distribution des langues Afro-Asiatiques a poussé Eyoab I. Gebremeskel à mener cette étude concrétisée par un nouveau papier intitulé: Y-chromosome E haplogroups: their distribution and implication to the origin of Afro-Asiatic languages and pastoralism. Le Sahel qui s'étend de l'Atlantique aux côtes soudanaises et érythréennes de la mer rouge, est le témoin d’événements démographiques importants dans la préhistoire et l'histoire humaine. Des preuves archéologiques et paléontologiques suggèrent une contribution importante des côtes érythréennes de la mer rouge dans des événements majeurs comme la sortie de l'Afrique de l'homo sapiens. De plus, cette région, riche en diversité génétique et linguistique, est une des rares enclaves qui abritent un pastoralisme traditionnel.

Un total de 1214 échantillons appartenant à l'haplogroupe E du chromosome Y, a été pris en compte dans cette analyse. Parmi toute la population érythréenne testée pour le chromosome Y, l'haplogroupe E représente 49%. Le langage et la culture de subsistance des différentes populations testées ont été répertoriés. 17 marqueurs de l'haplogroupe E ont été testés: E-M96, E-M33, E-P2, E-M2, E-M58, E-M191, E-M154, E-M329, E-M215, E-M35, E-M78, E-M81, E-M123, E-M34, E-V6, E-V16/E-M281 et E-M75.:
2014 Gebremeskel Figure S1

Les marqueurs E-V13, E-V12, E-V22 et E-V32 ont été regroupés ensemble sous E-M78.

Un réseau median-joining a été construit:
2014 Gebremeskel Figure 1

La racine se situe dans la population Kunama. Un groupe principal (en rose ci-dessus) englobe la plupart des populations érythréennes et soudanaises, incluant des populations de langues afro-asiatiques et nilo-sahariennes. Ceci indique que soit la divergence linguistique est un événement postérieur à la divergence génétique, soit qu'il y a eu un remplacement linguistique dans certaines populations, soit que les deux familles linguistiques ont une origine commune. Les populations sud-africaines sont issues de l'Afrique de l'est via une population somalienne. Cela pourrait résulter de la dispersion du pastoralisme de l'Afrique de l'est vers l'Afrique du sud. Les populations du Yémen, d'Arabie Saoudite et d'Oman forment un groupe du Moyen-Orient relié à la population de Afar et Saho. Les populations d'Afrique du nord se scindent en deux groupes: le premier contient les marocains arabes et berbères et les Sahraouis et dérive d'un groupe d'Afrique de l'est, le second inclut les algériens, égyptiens et tunisiens connectés à la fois aux européens et aux érythréens.

Un taux de mutation de 3.8 à 4.4x10-4 mutation par nucléotide et par génération a été pris pour calculer les temps de divergence des différentes populations.

Un arbre neighbor-joining a également été construit. Il montre des regroupements similaires au réseau précédent. A quelques exceptions près, toutes les populations de l'haplogroupe E sont reliées au pastoralisme.

Enfin, une échelle multi-dimensionnelle et une Analyse en Composantes principales ont été calculées à partir de la distance génétique:
2014 Gebremeskel Figure 3

Les deux analyses montrent un regroupement en 4 clusters. Le premier groupe (zone grise) comprend les populations d'Afrique de l'est. Les populations d'Afar et Saho se regroupent avec les populations du Moyen-Orient (zone bleue). Les populations d'Afrique de l'ouest et du sud forment le troisième groupe (zone marron). Le quatrième groupe (zone verte) est formé par les populations d'Afrique du nord.

Discussion

Les données de cette étude ont montré qu'il n'y a pas de différence génétique entre les différentes populations érythréennes quel que soit leur position géographique ou leur langue. Cela implique que cette région est probablement la scène d'événements démographiques les plus anciens, notamment la sortie d'Afrique de l'espèce humaine. Le groupe érythréen qui prend sa source chez les Kunamas pourrait représenter une dispersion ancienne le long des côtes de la mer rouge, tout juste postérieure à la sortie d'Afrique, à une date probablement proche de l'origine de l'haplogroupe E. L'expansion de l'haplogroupe E s'est ensuite propagée en différents endroits du continent africain. Ce type de migrations liées aux changements climatiques ou à la diffusion du pastoralisme est courant dans l'histoire humaine.

Ce groupe ancestral comprend les Fulani qui ont une histoire commune avec les Hausa. Ces derniers ont porté la langue Afro-asiatique à l'ouest du Sahel. Les Fulani qui parlent une langue Niger-Kordofanienne ont probablement perdu leur langue d'origine pour s'associer à un groupe sédentaire. Le groupe ancestral comprend également des populations de langue Nilo-saharienne comme les Kunamas d’Érythrée ou les Nilotiques du Soudan qui sont des pasteurs nomades mais ne parlent pas la langue Afro-asiatique pourtant majoritaire parmi les porteurs de l'haplogroupe E.

Les sous-clades du réseau dont certaines sont associées au pastoralisme, ont probablement émergé dans le Sahara, parmi une population qui parlait une langue ancestrale aux langages Afro-asiatiques et Nilo-sahariens. Le pastoralisme pourrait prendre ses origines à une date comprise entre 22.000 et 12.000 ans. Un scénario intéressant permettrait de regrouper l'origine du pastoralisme et l'origine des langues Afro-asiatiques et Nilo-sahariennes dans la même population ancestrale.

Le réseau regroupe les marocains arabes et berbères et les Saharaouis ensemble dans un cluster qui a probablement divergé des groupes d'Afrique de l'est il y a environ 32.000 ans à l'origine de l'haplogroupe E. Il est probable également que la haute fréquence de la sous-clade E-M81 en Afrique du nord et son association avec les populations de langue berbère soit consécutif à la scission de ce groupe ancien.

Un autre épisode migratoire est associé à la diffusion de la sous-clade E-M35 au delà des côtes de la mer rouge jusqu'au Moyen-Orient. Cet événement est probablement relié à des mouvements de plus vaste ampleur en Afrique de l'est, Afrique du nord, Europe et Afrique du sud, reliés à la diffusion du pastoralisme.