Généalogie génétique

La transition Néolithique en Europe a impliqué de profonds changements culturels et technologiques. En Europe Occidentale et Centrale, ces changements sont arrivés rapidement avec la venue de fermiers en provenance d'Anatolie. Plus à l'est, dans la région Baltique, cette transition a été progressive avec peu ou pas d'apport génétique des fermiers Anatoliens.

Gloria Gonzalez-Fortes et ses collègues viennent de publier un papier intitulé: Paleogenomic Evidence for Multi-generational Mixing between Neolithic Farmers and Mesolithic Hunter-Gatherers in the Lower Danube Basin. Ils ont étudié les interactions entre chasseurs-cueilleurs et fermiers en Roumanie dans le bassin du Danube. Pour cela ils ont séquencé le génome de quatre individus dont trois chasseurs-cueilleurs du Mésolithique datés entre 8800 et 8700 ans situés à Schela Cladovei et Ostrovul Corbului, et d'un individu de l'Énéolithique daté de 5300 ans situé à Gura Baciului. Les auteurs ont également séquencé le génome de deux chasseurs-cueilleurs Mésolithique d'Espagne situés à Chan do Lindeiro et à Los Canes.


Les trois chasseurs-cueilleurs de Roumanie ont la peau, les cheveux et les yeux sombres, alors que l'individu de l'Énéolithique de Roumanie a la peau plus claire, les cheveux sombres et les yeux clairs. Les quatre individus ne sont pas tolérants au lactose (gène MCM):


Un chasseur-cueilleur de Roumanie appartient à l'haplogroupe mitochondrial U5b fréquent en Europe Occidentale, alors qu'un autre appartient à l'haplogroupe U5a fréquent en Scandinavie et dans la région Baltique. Les deux autres individus de Roumanie appartiennent à l'haplogroupe mitochondrial K1, commun chez les premiers fermiers d'Anatolie et d'Europe. Les trois hommes du Mésolithique de Roumanie appartiennent également à l'haplogroupe du chromosome Y: R1 et R1b-M343, fréquent chez les Européens Occidentaux contemporains:


A noter cependant que les Mésolithiques de Roumanie sont négatifs pour la mutation M269, alors que les Européens Occidentaux contemporains sont quasiment tous positifs pour cette mutation.

Les auteurs ont également réalisé une Analyse en Composantes Principales pour comparer leurs génomes à celui d'autres échantillons anciens et contemporains:


Les trois chasseurs-cueilleurs de Roumanie se regroupent avec les autres individus du Mésolithique Européen, dont notamment les deux nouveaux génomes Ibériques. Ils sont également proches des individus contemporains d'Europe du Nord. A l'inverse, l'individu de l'Énéolithique de Roumanie se situe entre les chasseurs-cueilleurs Européens et les fermiers du Néolithique Européen. Ces résultats sont confirmés par l'analyse avec le logiciel ADMIXTURE:


Les trois chasseurs-cueilleurs de Roumanie (SC1_Meso, SC2_Meso et OC1_Meso) sont constitués d'une seule ascendance (en bleu) correspondant aux chasseurs-cueilleurs de l'Ouest, alors que l'individu de l'Énéolithique de Roumanie (GB1_Eneo) est constitué d'un mélange entre deux composantes chasseur-cueilleur (en bleu) et fermier Néolithique (en orange). De manière intéressante, cet individu a une forte proportion d'ascendance chasseur-cueilleur contrairement aux individus du Néolithique Moyen Européen. Également, contrairement aux individus de l'Âge du Bronze Européen, cet individu de l'Énéolithique de Roumanie ne possède pas la composante (en vert) issue des Steppes.

Les auteurs ont également mesuré les taux isotopiques de leurs échantillons. Ainsi, les trois chasseurs-cueilleurs de Roumanie avaient une diète basée sur une forte consommation de poissons d'eau douce, alors que l'individu de l'Énéolithique de Roumanie montre une diète basée sur un mélange entre poissons d'eau douce et produits terrestres.

De manière intéressante cette étude confirme le fait que la propagation du Néolithique dans le Nord-Est et l'Est de l'Europe est plus compliquée qu'un simple remplacement de populations. De nombreux échanges culturels ont eu lieu peut-être dû au fait que les conditions environnementales de ces régions n'étaient pas propice aux développement de l'agriculture, ou que la densité de chasseurs-cueilleurs était plus élevée dans ces régions.