Généalogie génétique

Les premières cultures néolithiques du Bassin parisien (Rubané Récent et Blicquy-Villeneuve-Saint-Germain) étaient principalement agricoles, la chasse n’ayant qu’un rôle marginal. Cependant, des influences méditerranéennes sont perceptibles dans certains objets archéologiques. La transition vers le Néolithique moyen se caractérise par l’apparition de sépultures monumentales (phénomène de Passy), qui témoignent d’une structuration sociale hiérarchisée et d’une différenciation culturelle. Les nécropoles monumentales de type Passy et Malesherbes, attribuées à la culture Cerny, révèlent une organisation funéraire complexe, souvent centrée sur des individus masculins et des objets liés à la chasse (pointes de flèches, ornements en os ou dents d’animaux sauvages). Cette prééminence de la chasse dans les pratiques funéraires contraste avec la rareté des objets agricoles dans les tombes, ce qui soulève la question d’une possible influence culturelle ou biologique des chasseurs-cueilleurs sur les communautés Cerny.

Juliette Sauvage et ses collègues vienne de publier un papier intitulé: Ancient DNA Reveals Limited Hunter-Gatherer Ancestry in the Cerny Culture (Middle Neolithic, France) Despite Hunting-Associated Practices. Ils ont analyser l'ADN issu de 80 anciens individus du néolithique ancien et moyen du basin parisien. Ils ont obtenu de bons résultats pour 28 de ces échantillons appartenant aux sites archéologiques de Balloy “Les Réaudins”, Gron “Les Sablons”, Marolles-sur-Seine “Les Carrières”, Marolles-sur-Seine “Les Taupes”, Orville “Les Fiefs”, Passy “La Sablonnière” et Vignely “La Porte aux Bergers”:



Ces génomes ont également été comparés à ceux obtenus dans les nécropoles de Gurgy et de Fleury-sur-Orne. Les résultats du chromosome Y montrent que chez les hommes du Néolithique ancien, deux haplogroupes Y (G2 et H2) ont été identifiés. Chez les hommes Cerny, trois haplogroupes Y (H2m, H2a1, I2a1a) sont présents, H2m étant le plus fréquent. La diversité mitochondriale est plus élevée : 4 haplogroupes différents chez les 5 individus du Néolithique ancien, et au moins 14 chez les 23 individus Cerny. Les haplogroupes mitochondriaux caractéristiques des chasseurs-cueilleurs (U) sont rares, tandis que ceux du « package néolithique » (N1a, T2, K, J, H, X) dominent. Deux individus (un du Néolithique ancien et un Cerny) ont pu faire l’objet d’une estimation du phénotype : tous deux avaient probablement les yeux bruns et une peau de couleur pâle à intermédiaire.

Les auteurs ont intégré les 28 nouveaux génomes séquencés à une vaste base de données de génomes anciens et modernes, puis ont utilisé plusieurs méthodes statistiques (PCA, ADMIXTURE, qpAdm, statistique f4) pour comparer la composition génétique des individus du Bassin parisien à celle d’autres populations néolithiques européennes. Sur la PCA, les individus du Néolithique ancien et ceux de la culture Cerny du Bassin parisien se regroupent génétiquement avec la majorité des agriculteurs néolithiques européens, sans affinité accrue avec les chasseurs-cueilleurs mésolithiques:



Les analyses montrent que la proportion d’ascendance WHG chez les individus Cerny est faible (en moyenne 6,6 %, variant de 0 à 22,3 %), similaire à celle observée dans d’autres groupes néolithiques contemporains d’Europe. Les tests statistiques confirment qu’il n’existe pas de différence significative d’ascendance WHG entre les groupes du Bassin parisien et d’autres groupes néolithiques du nord de la France ou d’Europe. L’origine de l’ascendance chasseurs-cueilleurs détectée chez les individus du Bassin parisien provient principalement des chasseurs-cueilleurs d’Europe de l’Ouest, et non d’Europe de l’Est. Les estimations de la date de mélange gééntique entre les agriculteurs anatoliens et les chasseurs-cueilleurs occidentaux situent cet événement entre 6400 et 6000 av. JC., soit environ 1000 ans avant l’apparition de la culture Cerny. Les traits culturels liés à la chasse observés dans les sépultures Cerny ne reflètent donc pas une influence biologique directe des chasseurs-cueilleurs, mais plutôt une évolution interne ou des emprunts culturels au sein des communautés néolithiques locales.

Les groupes Cerny du Bassin parisien sont génétiquement plus proches des autres groupes néolithiques du nord de la France que des agriculteurs méditerranéens ou d’Europe centrale. L’analyse du partage d’haplotypes montre que les individus du Bassin parisien et de Normandie forment un groupe génétiquement homogène, à l’exclusion des groupes de l’est de la France. Malgré des similarités culturelles entre la culture Cerny du Bassin parisien et celle de Normandie (Fleury-sur-Orne), la proximité génétique la plus forte est observée entre les groupes Cerny du Bassin parisien et le groupe non-Cerny de Gurgy, situé à proximité géographique. La proximité génétique observée est donc davantage liée à la géographie qu’aux affinités culturelles, et suggère des échanges et un flux de gènes principalement à l’échelle régionale.

Les analyses génétiques montrent que les liens familiaux proches (du 1er au 3e degré) sont très rares parmi les individus inhumés dans les nécropoles Cerny : seuls deux cas de parenté proche ont été identifiés impliquant au moins un individu Cerny du Bassin parisien. Un lien de premier degré (père-fils) a été identifié entre deux hommes adultes (VPB180 et VPB181) enterrés dans des tombes adjacentes à Vignely « La Porte aux Bergers ». Ils partagent le même haplogroupe Y (H2m) mais des haplogroupes mitochondriaux différents, ce qui confirme la relation paternelle. Un lien de second degré a été détecté entre un adulte (PAS6-1) de Passy « La Sablonnière » et un enfant (GLS356-1) de Gron « Les Sablons », deux sites distants de quelques kilomètres. Ce lien pourrait correspondre à des demi-frères, un grand-père et son petit-fils, ou un oncle et son neveu. Aucun lien de parenté proche n’a été trouvé entre les individus Cerny du Bassin parisien et ceux des sites de Gurgy ou Fleury-sur-Orne. L’analyse des segments IBD (>20 cM) révèle également très peu de relations génétiques distantes entre les individus Cerny, et aucune structure familiale dense n’a été détectée. Les nécropoles Cerny du Bassin parisien ne sont pas organisées autour de réseaux familiaux étroits, contrairement à d’autres sites contemporains comme Gurgy où la structure familiale est très marquée. Les individus inhumés dans les monuments Cerny partagent un statut privilégié mais ne sont généralement pas apparentés de près, ce qui suggère une sélection sociale plutôt que familiale pour l’accès à ces sépultures monumentales.

Seul le génome de l’individu MART97 (Néolithique ancien) présente de longs segments ROH, ce qui indique que ses parents étaient apparentés (par exemple, cousins au second degré). Les résultats montrent que la population Cerny du Bassin parisien ne pratiquait pas l’endogamie à un niveau détectable par les analyses génétiques, contrairement à certains cas isolés du Néolithique ancien. Cette absence de consanguinité, combinée à la diversité des haplogroupes mitochondriaux, suggère que les Cerny faisaient partie d’une population relativement nombreuse et ouverte, évitant les unions entre proches parents. Cela reflète une organisation sociale où les échanges et le brassage génétique étaient importants à l’échelle régionale.