samedi 18 octobre 2025

Anciens génomes de l'est du Kazakhstan entre le début du Néolithique et la fin de l'Âge du Bronze

Les populations de l'Asie Intérieure sont remarquablement diverses bien que principalement structurées le long de trois gradients reflétant différentes zones écologiques et géographiques. Les récentes études de paléo-génomique ont permis de reconstruire les différents processus démographiques de la région au cours du temps qui ont contribué à la diversité génétique actuelle. Cependant le passé des chasseurs-cueilleurs et leur héritage actuel demeure moins bien compris.

Haechan Gill et ses collègues viennent de publier un papier intitulé: Ancient genomes from eastern Kazakhstan reveal dynamic genetic legacy of Inner Eurasian hunter-gatherers. Ils ont analysé le génome de 21 anciens individus issus du site archéologique de Koken localisé à l'est du Kazakhstan dans le haut bassin de la rivière Irtysh situé dans les contreforts des montagnes de l'Altaï, et datés entre le début du Néolithique (entre 5477 et 5222 av. JC.) et la fin de l'Âge du Bronze (entre 1875 et 1407 av. JC.):

2025_Gill_Figure1.png, oct. 2025

Les deux individus du début du Néolithique sont les plus vieux restes humains du Kazakhstan, alors que les tumulus de l'Âge du Bronze sont associés à la culture Andronovo. Les auteurs ont réalisé une Analyse en Composantes Principales pour comparer les génomes de cette étude à d'autres génomes préalablement publiés. Comme attendu les deux individus du début du Néolithique du site de Koken (symbole carré et losange jaune) ont des profils génétiques très différents de celui des individus de l'Âge du Bronze du même site (symbole rond et triangle jaune):

2025_Gill_Figure2C.png, oct. 2025

Les deux premiers sont situés sur le gradient vert des chasseurs-cueilleurs de Sibérie reliant les Anciens Nord Eurasiens (ANE) et les Anciens Paléo-Sibériens (APS). A l'inverse les individus de l'Âge du Bronze forment un groupe avec les anciens individus de l'Âge du Bronze d'Asie centrale appartenant à la culture Andronovo à l'intersection des gradient rouge et violet à gauche de la figure. Ils possèdent beaucoup plus d'affinité génétique avec les populations actuelles d'Eurasie occidentale. Il y a cependant parmi eux deux outliers dont un est situé sur le gradient violet et l'autre sur le gradient rouge décalé vers les Anciens Nord Eurasiens. Ces individus atypiques reflètent potentiellement une histoire de mélange génétique entre les chasseurs-cueilleurs locaux et les pasteurs d'Eurasie occidentale arrivant dans la région.

Les deux individus du début du Néolithique sont deux hommes reliés au second degré. Ils peuvent être oncle et neveu ou deux demi-frères. Ils partagent l'haplogroupe du chromosome Y: N. La distribution des segments IBD exclut une relation grand-père/petit-fils, ou une relation entre deux cousins. Comme ils sont séparés sur le gradient vert, cela implique une relation familiale entre des individus aux profils génétiques distincts, plus ou moins proches des populations ANE et APS. L'utilisation du logiciel qpAdm montre que Koken_EN1 peut être modélisé comme issu d'un mélange génétique entre Koken_EN2 (75,7%) et une population d'Anciens Paléo-Sibériens (symboles rouges), ou bien Koken_EN2 est issu d'un mélange génétique entre Koken_EN1 (78%) et une population de chasseurs-cueilleurs de l'île de Sosnoviy (triangles gris pointe vers le bas) près de la ville de Novosibirsk, et datée de 6000 ans.

Les auteurs ont remarqué que les anciens individus positionnés sur la PCA sur le gradient vert ne sont pas uniformément répartis, mais se regroupent plutôt en clusters associés chacun au bassin d'une rivière. Ainsi en gris, on a des individus appartenant au bassin des rivières Tobol ou Ishim dans l'ouest de la Sibérie et dont le cours est parallèle. Ensuite on a un groupe des anciens individus localisés à l'ouest du bassin de la rivière Irtysh représentés par les carrés et losanges vert, puis un second groupe des anciens individus localisés à l'est du bassin de la rivière Irtysh représentés par les triangles verts. Le dernier cluster regroupe les anciens individus localisés dans le bassin de la rivière Ob proche des montagnes de l'Altaï et Saïan et représentés par des symboles orange:

2025_Gill_Figure2A.png, oct. 2025

Les auteurs ont ensuite utilisé le logiciel qpAdm afin de modéliser le génome des anciens individus à partir des ascendances ANE, EHG (chasseurs-cueilleurs de l'est) et APS représentés dans la figure ci-dessous respectivement par un individu de l'Âge du Bronze du bassin du Tarim (Tarim_EMBA1), un chasseur-cueilleur du site de Yuzhniy Oleniy Ostrov en Carélie (UOO_M) et l'Ancien Paléo Sibérien: irk030. La figure ci-dessous montre que l'ascendance EHG décroit de l'ouest vers l'est, alors que dans le même temps l’ascendance APS augmente:

2025_Gill_Figure3A.png, oct. 2025
Comme Koken_EN1 est le plus ancien individu du bassin de la rivière Irtysh avec très peu d'ascendance EHG et Mergen6_HG le plus ancien individu du bassin de la rivière Tobol sans ascendance APS, les auteurs ont essayé de modéliser tous les anciens individus des rivières Tobol et Irtysh à partir du profil génétique de ces deux individus:

2025_Gill_Figure3B.png, oct. 2025

Les auteurs ont ensuite analysé le génome des anciens individus du site archéologique de Koken datés de l'âge du Bronze. Sur la PCA ils se regroupent avec tous les autres individus de la steppe des cultures Sintashta et Andronovo. Le logiciel qpAdm permet de modéliser ces individus comme issus d'un mélange génétique entre une population des pasteurs de la culture Sintashta (95%) et une population de chasseurs-cueilleurs locaux (5%). Le meilleur résultat est obtenu en prenant l'individu Koken_EN1.

Les deux anciens individus atypiques parmi ceux du site de Koken de l'âge du Bronze montrent que les pasteurs des steppes se sont mélangés dans une faible mesure aux populations locales le long de leurs voies de dispersion. Ainsi le premier incorpore un flux de gènes ANE dans son génome, alors que le second incorpore un flux de gène venus de l'Asie de l'est.

jeudi 2 octobre 2025

Mélange génétique entre les populations associées au Gravettien d'Europe de l'Est et de l'Ouest en Europe

2025_Gelabert_Figure2A.png, oct. 2025

Le Gravettien est une ancienne culture paléolithique datant d'avant le dernier maximum glaciaire. Malgré une certaine similarité de la technologie, la culture Gravettienne n'était pas totalement homogène. Ainsi neuf groupes régionaux ont été identifiés archéologiquement. Les génomes Gravettiens  […]

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jeudi 25 septembre 2025

Une nouvelle découverte d'une sépulture campaniforme individuelle à Saint Martin la Garenne

Sépulture campaniforme féminine de Saint Martin la Garenne.png, sept. 2025

Le musée de la préhistoire d'Île de France à Nemours présente actuellement une exposition intitulée: Pouvoir et métal - L'âge du Bronze en Île-de-France, de 2300 à 800 avant notre ère. Cette exposition démarre sur l'utilisation de l'or et du cuivre à la fin du Néolithique. A cette occasion elle  […]

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samedi 30 août 2025

Génomes provenant d'une communauté de la fin de l'âge du bronze enterrée dans un tumulus du nord-est de la péninsule Ibérique

2025_Bretos_Figure1.png, août 2025

La diversité génétique européenne a été façonnée par différents événements démographiques clés, dont la dernière transformation majeure était l'afflux de migrants issus de pasteurs de la steppe ponto-caspienne entre 3000 et 2000 av. JC. A l'âge du bronze, divers groupes culturels ont émergé et se  […]

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lundi 11 août 2025

Étude paléogénétique d'une nécropole de la fin de l’Antiquité et du début du Moyen Âge à Angers

2025_Pruvost_Figure1.png, août 2025

Traversée par la Maine peu avant sa confluence avec la Loire, la ville d'Angers est occupée par l'homme depuis au moins le néolithique. À la fin de l’Antiquité, la cité des Andécaves, ancien peuple gaulois, est l’un des derniers territoires qui perdure sous l’Empire romain et reste aujourd’hui une  […]

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mercredi 23 juillet 2025

Histoire génomique de l'Italie du nord-est entre le mésolithique et l'âge du bronze

2025_Croze_Figure1.png, juil. 2025

Les Alpes italiennes de l'est ont joué un rôle de pont entre les populations du nord des Alpes et celles du sud des Alpes. Durant le dernier maximum glaciaire les Alpes étaient recouvertes de glaciers. Après 18.000 ans les glaciers se sont retirés peu à peu laissant la place à une population de  […]

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vendredi 4 juillet 2025

Génome d'un individu de l'Ancien Empire Égyptien

2025_MorezJacobs_Figure1.png, juil. 2025

La civilisation égyptienne a développé une architecture monumentale et un système de croyances stable pendant des millénaires entre 3150 et 30 av. JC. A la suite de la réunification politique de l’Égypte à la fin du quatrième millénaire av. JC., l'Ancien Empire a connu des progrès considérables dont  […]

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mardi 24 juin 2025

L'homme de Harbin en Chine est un Dénisovien

2025_Fu_Figure1A.png, juin 2025

Les Dénisoviens sont un groupe d'anciens hominidés d'Asie identifié à partir de l'analyse ADN de fossiles issus de la grotte Denisova située en Sibérie. Les fossiles actuels attribués à l'homme de Denisova représentent quelques dents et quelques fragments d'os. Des analyses protéomiques précédentes  […]

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samedi 21 juin 2025

ADN ancien en Colombie entre 6000 et 500 ans

2025_Krettek_Figure1.png, juin 2025

Les études précédentes de paléo-génétique ont montré que les populations Amérindiennes en dehors de la zone arctique, dérivent d'un mélange génétique entre une population est asiatique et une population sibérienne qui a eu lieu quelque part dans le nord est de l'Asie il y a plus de 20.000 ans. Il y  […]

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dimanche 15 juin 2025

Transition entre le Néolithique et l'Âge du Bronze à Mas d’en Boixos en Catalogne

2025_Roca-Rada_Figure1.png, juin 2025

Mas d’en Boixos est le site archéologique le plus significatif de la région de Penedès en Catalogne située entre Barcelone et Tarragone. Les fouilles débutées en 1997 ont livré 450 structures datées entre le début du Néolithique et la fin de l'Âge du Fer soit entre 5500 et 200 av. JC. Ce site est  […]

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samedi 3 mai 2025

Continuité génétique dans la culture des Pueblos au Nouveau Mexique

2025_Pinotti_Figure1.png, mai 2025

Les anciens pueblos créés par la culture ancestrale des Pueblos, un terme indiquant leur relation ancestrale avec les tribus amérindiennes contemporaines des Pueblos, comptent parmi les cultures archéologiques les plus reconnaissables d'Amérique du Nord. De nombreux pueblos anciens sont devenus le  […]

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vendredi 25 avril 2025

Anciens génomes des communautés Phéniciennes et Puniques

2025_Ringbauer_Figure1a.png, avr. 2025

La culture phénicienne a émergé dans des cités états de l'Âge du Bronze du Levant. Au début du premier millénaire av. JC., les phéniciens ont établi un vaste réseau commercial le long des côtes méditerranéennes jusque sur les côtes sud-ouest de la péninsule Ibérique, diffusant leur culture, leur  […]

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lundi 14 avril 2025

La mandibule d'un homme de Denisova à Taïwan

2025_Tsutaya_Figure1.png, avr. 2025

Les Dénisoviens ont été reconnus comme un groupe humain distinct des hommes modernes et des hommes de Néandertal par l'analyse ADN de restes osseux et dentaires issus de la grotte de Denisova située dans l’Altaï au sud de la Sibérie. Leur génome nucléaire a montré qu'ils formaient un groupe frère  […]

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lundi 7 avril 2025

Génomes anciens du Sahara vert

2025_Salem_Figure1.png, avr. 2025

Après le dernier maximum glaciaire, une transformation climatique au Sahara a conduit à une période Africaine humide qui a été maximale entre 11.000 et 5000 ans. A cette époque le Sahara était une savane dans laquelle le paysage alternait entre couverture arborée variable, lacs permanents et système  […]

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dimanche 30 mars 2025

Histoire génétique de la région Rhin-Meuse

2025_Olalde_Figure1.jpg, mar. 2025

La région Rhin-Meuse s'étend au Pays-Bas, en Belgique et dans le nord-ouest de l'Allemagne. Elle est caractérisée par un environnement riche en eau. Vers 5500 av. JC. le sud de cette région voit l'arrivée de fermiers colons appartenant à la culture rubanée qui se sont installés dans des zones  […]

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lundi 17 mars 2025

Génomes anciens en Afrique du nord

2025_Lipson_Figure1.png, mar. 2025

Sur la côte Méditerranéenne de l'Europe, la transition néolithique se caractérise par la migration de populations venues d'Anatolie qui ont atteint la péninsule Ibérique il y a 7500 ans. Ces populations ont absorbé jusqu'à 30% d'ascendance des chasseurs-cueilleurs de l'ouest. La culture est alors  […]

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mardi 4 mars 2025

Diffusion des langues celtiques

2025_McColl_Figure1.png, mar. 2025

Le paysage linguistique de l'Europe actuel est dominé par les langues Romanes, Germaniques et Slaves qui se sont diffusées relativement récemment durant l'Âge du Fer et après l'émergence de l'empire Romain et des migrations barbares. Cependant avant ces événements, les langues celtiques dominaient  […]

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mardi 25 février 2025

Anciens génomes de nourrissons sur le site de Lepenski Vir en Serbie

2025_Zegarac_Figure1.png, fév. 2025

Un des rares sites archéologiques qui témoigne des interactions entre chasseurs-cueilleurs et fermiers est localisé à Lepenski Vir proche de la frontière entre la Serbie et la Roumanie. Les fouilles dans les gorges du Danube ont révélé des habitats et des sépultures fournissant plus de 500 restes  […]

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lundi 10 février 2025

Transition entre la fin du Néolithique et le début de l'Âge du Cuivre dans le bassin des Carpates

2025_Nagy_Figure1.png, fév. 2025

La géographie du bassin des Carpates en fait un carrefour entre l'Europe du sud-est et l'Europe centrale. Les vallées fertiles du Danube et de ses affluents offrent des conditions optimales pour l'installation des habitats préhistoriques et pour faciliter leurs réseaux de communication et d'échange.  […]

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mardi 21 janvier 2025

Matrilocalité dans la Grande-Bretagne de l'âge du fer

2025_Cassidy_Figure1.png, janv. 2025

Une société matrilocale dans laquelle les époux viennent habiter auprès des parents de leur femme est relativement rare, alors que les sociétés patrilocales sont beaucoup plus nombreuses. De plus dans la plupart des anciennes sociétés préhistoriques d'Europe avec suffisamment de données  […]

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